员工不遵守公司制度能否辞退的法律依据，主要来自《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定。
根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条第二项，劳动者“严重违反用人单位的规章制度的”，用人单位可以解除劳动合同。适用该条款需满足三个核心条件：一是规章制度本身合法（需经职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定，内容不违反法律、行政法规）；二是规章制度已向员工公示或告知（如员工手册签字确认、公司内网公示记录等）；三是员工的违规行为达到“严重”标准（需结合行为性质、后果、公司行业特性等综合判断，如餐饮企业员工擅自使用过期食材，属于严重违反食品安全制度）。若同时满足上述条件，公司辞退员工的行为合法；反之，如制度未公示或违规不严重，则辞退可能违法。
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员工不遵守公司制度时，公司辞退可能面临以下法律风险：
1. 违法解除劳动合同的赔偿风险：例如，某公司以员工“未按规定提交日报”为由辞退，但制度中未明确“未提交日报属于严重违规”，员工申请仲裁后，仲裁委认定公司违法解除，判决公司支付2N（N为员工工作年限）的赔偿金。
2. 证据链断裂导致败诉的风险：例如，公司主张员工连续旷工3天，但仅提供考勤记录（无员工签字确认），员工辩称是公司未安排工作，因公司无法补充其他证据（如旷工通知、短信提醒记录），最终败诉。
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员工不遵守公司制度是否能辞退，需结合制度合法性、员工违规程度等因素判断。以下分情况详细说明：
1. 若公司规章制度内容合法、已依法公示或告知员工，且员工行为属于严重违反制度的情形（如连续旷工多日、营私舞弊给公司造成重大损失等），公司可以辞退员工且无需支付经济补偿。
2. 若公司规章制度未经过民主程序制定、内容违反法律法规（如规定女职工不得结婚生育），或未向员工公示/告知，即使员工存在违规行为，公司辞退也可能构成违法解除。
3. 若员工违规行为未达到“严重”程度（如首次迟到5分钟、偶尔忘记打卡且未造成实际影响），公司不得直接辞退，需先通过警告、批评教育等方式处理。
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员工不遵守公司制度的处理中，存在以下特殊情况或例外情形，会影响辞退的合法性：
1. 员工违规是因不可抗力或公司过错导致：例如，员工因突发地震导致迟到3小时，或公司考勤系统故障导致员工无法打卡，此时即使制度规定“迟到1小时算违规”，公司也不得以此辞退员工，否则构成违法解除。
2. 规章制度对“严重违规”的约定过于模糊：例如，制度仅写“员工严重违反制度的，公司可辞退”，但未明确具体行为（如旷工天数、损失金额标准），此时公司以“严重违规”辞退员工，仲裁或法院可能因约定不明确而不支持公司主张。
3. 员工处于特殊保护期（如孕期、医疗期）：即使员工存在轻微违规，公司也不得辞退；若员工存在严重违规（如挪用公款），则不受特殊保护期限制，公司仍可依法辞退，但需确保证据充分、程序合法。

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